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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
东西问·速读丨胡润：外企对在中国进行新投资仍有浓厚兴趣******
中新社北京1月19日电 (记者 彭大伟 李金磊)当前，中美关系遭遇冲击，徘徊在建交后的低谷。但美对华实际投资并未遭遇“冰冻”。
中国商务部1月18日公布的数据显示，2022年中国实际使用外资金额12326.8亿元人民币，按可比口径同比增长6.3%，折合美元为1891.3亿美元，同比增长8%。
“数据表明，外国企业对投资中国依然有浓厚的兴趣。”《胡润百富》创刊人和首席研究员胡润近日在中新社“东西问·中外对话”栏目中说。
胡润表示，以在中国的外资及港澳台企业百强为例，这些公司在中国大陆经营的时间平均是57年，平均“年龄”91岁。大概有15到20家公司在中国经营超过100年。
资料图：上海洋山深水港。中新社记者 田雨昊 摄在他看来，这些公司有非常长期的战略，中国对它们来说是重要市场。它们在这里增加价值，也作出贡献。
“让我印象最深刻的是这些公司的长期投资和长远眼光。”胡润说，这不是“我在这里赚个快钱然后拍拍屁股就走”的问题，有些公司是这么做的，但这些百强公司不是这样。
上海美国商会会长郑艺也认为，美国公司会继续视中国为首要战略市场。美国商会的成员已经在这里做了很多年生意，在中国进行长期投资，也为中国的发展作出贡献。这已不仅仅是全球供应链的一部分。
“中国市场潜力很大，所以它们在这里有很好的销量表现。外国投资对中国市场仍感兴趣。”郑艺说。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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